РНПЦ эпидемиологии и микробиологии является национальным научно-методическим центром, где выполняется широкий спектр научно-исследовательских работ фундаментального и прикладного характера в области эпидемиологии, медицинской вирусологии, микробиологии, иммунологии и паразитологии, разрабатываются и производятся лечебные, диагностические и профилактические препараты, проводятся консультации по методам исследований и диагностике инфекций, их профилактике.